هزینه درمان با در نظر گرفتن انتظاری که بعد از انجام این روش وجود دارد و تعداد نواحی که قرار است درمان شود متغیر است، قدرت دستگاه برای درمان مهم است و از عوامل تعیین کننده در هزینه آر اف فرکشنال به حساب می آید، کلینیک یا مرکز درمانی انتخابی برای استفاده از این روش یکی دیگر از عوامل موثر است، بخشی از بدن که قرار است تحت درمان قرار بگیرد و مدت زمانی که پزشک باید برای درمان و از بین رفتن مشکلات پوستی در این ناحیه صرف کند باعث تغییر هزینه می شود، تخصص پزشک و میزان دستمزد دریافتی که به عوامل مختلف بستگی دارد، تعداد جلسات درمانی که با توجه به نوع مشکلات پوستی تعیین می‌شود در بیشتر و کمتر شدن هزینه آر اف فرکشنال صورت موثر است.